El Sharktopus ha sido destruido, pero una bióloga marina llamada Lorena Christmas (Katie Savoy) encuentra un huevo del monstruo, y no tiene mejor idea que criarlo en el acuario de su tío. Mientras tanto, el científico Rico Symes (Robert Carradine) crea un monstruo que es mitad pterodáctilo mitad barracuda: el Pteracuda. Las cosas se salen de control y éste termina escapándose y convirtiéndose en una verdadera amenaza tanto por tierra como por mar y por aire. Soltar al Sharktopus para que se enfrente al Pteracuda parece ser la única opción para poder detenerlo...
